化学学报 ›› 2006, Vol. 64 ›› Issue (9): 949-952. 上一篇 下一篇
研究论文
梅虎1,2,周原1,廖志华3,李志良*,1,2
MEI Hu1,2, ZHOU Yuan1, LIAO Zhi-Hua3, LI Zhi-Liang*,1,2
采用VHSE氨基酸结构描述子表征HLA-A*0201限制性表位结构, 以遗传算法和偏最小二乘相结合(GA-PLS)对102个训练集进行定量构效关系建模. 剔除3个异常样本后, 据候选模型交互检验及50个外部测试集预测结果, 筛选得到最优偏最小二乘模型(A=2), 其R2, Q2和 分别为0.755, 0.621和0.680. 构效研究显示: CTL表位活性主要与1, 2, 7, 8, 9位氨基酸残基疏水、1, 2位立体及6位残基电性等性质密切相关.