化学学报 ›› 2009, Vol. 67 ›› Issue (10): 1098-1102. 上一篇 下一篇
研究论文
缪有盼a 李爱秀*,a,b 刘 涛a 吴可柱a 马 翼c
(a中国人民武装警察部队医学院基础医学部药物设计实验室 天津 300162)
(b中国人民武装警察部队医学院职业与环境危害生物标志物天津市重点实验室 天津 300162)
(c南开大学元素有机化学国家重点实验室 天津 300071)
Miao, Youpan a Li, Aixiu *,a,b Liu, Tao a Wu, Kezhu a Ma, Yi c
基于“底物包膜”假说, 以现有HIV-1蛋白酶抑制剂Darunavir为模板构建药效团模型并对中药化学数据库进行搜索; 采用分子对接方法进一步考察化合物与HIV-1蛋白酶结合情况及其与“底物包膜”符合程度, 优先选出两个化合物Annomonicin和去乙酰蟾蜍它灵; 应用分子动力学方法对这两个化合物进行动力学模拟, 观察它们与蛋白酶结合的复合物在动力学过程中的稳定性并计算其结合自由能, 综合评价筛选结果, 最终确定化合物Annomonicin具有更潜在的深入研究价值.