化学学报 ›› 2010, Vol. 68 ›› Issue (13): 1277-1284. 上一篇 下一篇
研究论文
曹凯*,1,黄路#,2,林治华3,舒勇1,韩智敏1,黄山虎1,廖翔1,王远强3,彭方毅3,安洪4
Cao Kai*,1 Huang Lu2 Lin Zhihua3 Shu Yong1 Han Zhimin1 Huang Shanhu1 Liao Xiang1, Wang Yuanqiang3 Peng Fangyi3 An Hong4
为获得尤文肉瘤EWS-FLI1融合蛋白有效的HLA-A2.1限制性CTL表位, 综合运用BIMAS, SYFPEITHI, Predep和IEDB方案对EWS-FLI1进行CTL表位的预测, 得出8个CTL表位9肽序列; 应用多项式方案、量化基序方案对8个表位9肽进一步进行筛选, 获得其中4个9肽序列, 并进一步运用分子模拟方法初步模拟了4个表位肽与HLA-A2.1分子间的相互结合作用; 应用标准Fmoc方案合成CTL表位肽, RP-HPLC与MS分别鉴定合成肽的纯度与分子量; 通过亲和力实验验证了表位肽QIQLWQFLL(EWS-FLI1 304)与HLA-A2.1有较强的结合力, 从而为表位肽的后继免疫学特性研究提供了基础. 本研究提供了一个合理高效的表位筛选方法.