[1] Mcevoy, J. P.; Brudvig, G. W. Chem. Rev. 2006, 106, 4455.
[2] Najafpour, M. M.; Govindjee Dalton Trans. 2011, 40, 9076.
[3] (a) Cox, N.; Pantazis, D. A.; Neese, F.; Lubitz, W. Acc. Chem. Res. 2013, 46, 1588;
(b) Navarro, M. P.; Neese, F.; Lubitz, W.; Pantazis, D. A.; Cox, N. Curr. Opin. Chem. Biol. 2016, 31, 113.
[4] Pantazis, D. A.; Ames, W.; Cox, N.; Lubitz, W.; Neese, F. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 9935.
[5] Bovi, D.; Narzi, D.; Guidoni, L. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 1.
[6] (a) Retegan, M.; Krewald, V.; Mamedov, F.; Neese, F.; Lubitz, W.; Cox, N.; Pantazis, D. A. Chem. Sci. 2015, 7, 72;
(b) Narzi, D.; Bovi, D.; Guidoni, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2014, 111, 8723.
[7] (a) Siegbahn, P. E. M. Acc. Chem. Res. 2009, 42, 1871;
(b) Siegbahn, P. E. M. Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2013, 1827, 1003;
(c) Siegbahn, P. E. M. Chem. Eur. J. 2006, 12, 92175.
[8] Yang, Z.-Z.; Wang, C.-S. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 6315.
[9] Noodleman, L. J. Chem. Phys. 1981, 74, 5737.
[10] Suga, M.; Akita, F.; Hirata, K.; Ueno, G.; Murakami, H.; Nakajima, Y.; Shimizu, T.; Yamashita, K.; Yamamoto, M.; Ago, H.; Shen, J.-R. Nature 2015, 517, 99.
[11] Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225.
[12] Ponder, J. W. Tinker version 8.0, Washington University, Saint Louis, Missouri 2016 (https://dasher.wustl.edu/tinker).
[13] Cox, N.; Retegan, M.; Neese, F.; Pantazis, D. A.; Boussac, A.; Lubitz, W. Science 2014, 345, 804.
[14] Guo, Y.; He, L.-L.; Zhao, D.-X.; Gong, L.-D.; Liu, C.; Yang, Z.-Z. Phys. Chem. Chem. Phys. 2016, 18, 31551.
[15] Cohen, A. J.; Mori-Sánchez, P.; Yang, W. Chem. Rev. 2012, 112, 289.
[16] Siegbahn, P. E. M.; Blomberg, M. R. A. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 268.
[17] Roy, L. E.; Hay, P. J.; Martin, R. L. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1029.
[18] Li, X.; Siegbahn, P. E. M. Chem. Eur. J. 2015, 21, 1.
[19] Marenich, A. V.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 6378.
[20] Grimme, S.; Ehrlich, S.; Goerigk, L. J. Comput. Chem. 2011, 32, 1456.
[21] Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Scalmani, G.; Barone, V.; Mennucci, B.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Caricato, M.; Li, X.; Hratchian, H. P.; Izmaylov, A. F.; Bloino, J.; Zheng, G.; Sonnenberg, J. L.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Vreven, T.; Montgomery Jr., J. A.; Peralta, J. E.; Ogliaro, F.; Bearpark, M. J.; Heyd, J.; Brothers, E. N.; Kudin, K. N.; Staroverov, V. N.; Kobayashi, R.; Normand, J.; Raghavachari, K.; Rendell, A. P.; Burant, J. C.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Cossi, M.; Rega, N.; Millam, N. J.; Klene, M.; Knox, J. E.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Martin, R. L.; Morokuma, K.; Zakrzewski, V. G.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Farkas, Ö, Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cioslowski, J.; Fox, D. J., Gaussian 09, Revision D.01, Gaussian, Inc., Wallingford, CT, USA, 2013.
[22] Yang, Z.-Z.; Wang, J.-J.; Zhao, D.-X. J. Comput. Chem. 2014, 35, 1690.
[23] Krewald, V.; Retegan, M.; Cox, N.; Messinger, J.; Lubitz, W.; Debeer, S.; Neese, F.; Pantazis, D. A. Chem. Sci. 2015, 6, 1676.
[24] (a) Wang, F.-F.; Zhao, D.-X.; Yang, Z.-Z. Chem. Phys. 2009, 360, 141;
(b) Li, H.; Sun, T.-T.; Zhang, C.; Liu, L.; Zhao, D.; Yang, Z. Chin. J. Chem. 2017, 35, 354;
(c) Wang, F.-F.; Zhao, D.-X.; Yang, Z.-Z. Comput. Theor. Chem. 2011, 970, 36;
(d) Yu, C.-Y.; Yang, Z.-Z. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 2615;
(e) Liu, L.-L.; Yang, Z.-Z.; Zhao, D.-X.; Gong, L.-D.; Liu, C. RSC Adv. 2014, 4, 52083;
(f) Zou, H.; Zhao, D.; Yang, Z. Acta Chim. Sinica 2013, 71, 1547. (邹惠园, 赵东霞, 杨忠志, 化学学报, 2013, 71, 1547);
(g) Zhao, F.; Liu, C.; Gong, L.; Yang, Z. Acta Chim. Sinica 2011, 69, 1141. (赵飞耀, 刘翠, 宫利东, 杨忠志, 化学学报, 2011, 69, 1141.);
(h) Zhang, Q.; Zhao, D.; Yang, Z. Acta Chim. Sinica 2011, 69, 375. (张秋菊, 赵东霞, 杨忠志, 化学学报, 2011, 69, 375);
(i) Yang, Z.; Meng, X.; Zhao, D.; Gong, L. Acta Chim. Sinica 2009, 67, 2074. (杨忠志, 孟祥凤, 赵东霞, 宫利东, 化学学报, 2009, 67, 2074);
(j) Zhang, Q.; Zhang, X. Acta Chim. Sinica 2008, 66, 289. (张强, 张霞, 化学学报, 2008, 66, 289);
(k) Guan, Q.-M.; Yang, Z.-Z. Chin. J. Chem. 2007, 25, 727;
(l) Chen, S.-L.; Yang, Z.-Z. Chin. J. Chem. 2010, 28, 2109;
(m) Wang, H.-R.; Liu, C.; Yang, Z.-Z. Acta Chim. Sinica 2010, 68, 753. (王华荣, 刘翠, 杨忠志, 化学学报, 2010, 68, 753).
[25] Yang, Z.-Z.; Cui, B.-Q. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 1561.
[26] Wu, Y.; Yang, Z.-Z. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 7563.
[27] (a) Zhao, D.-X.; Liu, C.; Wang, F.-F.; Yu, C.-Y.; Gong, L.-D.; Liu, S.-B.; Yang, Z.-Z. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 795;
(b) Li, X.; Yang, Z.-Z. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 4102;
(c) Gong, L.-D. Sci. China: Chem. 2012, 55, 2471;
(d) He, L.-L.; Guo, Y.; Zhao, J.; Jiang, X.; Yang, Z.; Zhao, D. Acta Phys.-Chim. Sin. 2016, 32, 2921.
[28] Cox, N.; Messinger, J. Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2013, 1827, 1020.
[29] (a) Navarro, M. P.; Ames, W. M.; Nilsson, H.; Lohmiller, T.; Pantazis, D. A.; Rapatskiy, L.; Nowaczyk, M. M.; Neese, F.; Boussac, A.; Messinger, J.; Lubitz, W.; Cox, N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 15561;
(b) Oyala, P. H.; Stich, T. A.; Debus, R. J.; Britt, R. D. J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 8829;
(c) Schraut, J.; Kaupp, M. Chem. Eur. J. 2014, 20, 7300.
[30] Ames, W.; Pantazis, D. A.; Krewald, V.; Cox, N.; Messinger, J.; Lubitz, W.; Neese, F. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 19743.
[31] (a) Shoji, M.; Isobe, H.; Yamanaka, S.; Umena, Y.; Kawakami, K.; Kamiya, N.; Shen, J.-R.; Nakajima, T.; Yamaguchi, K. Adv. Quantum Chem. 2014, 70, 325;
(b) Debus, R. J. Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2015, 1847, 19;
(c) Isobe, H.; Shoji, M.; Shen, J.-R.; Yamaguchi, K. J. Phys. Chem. B 2015, 119, 13922.
[32] Siegbahn, P. E. M. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 9442.
[33] Hendry, G.; Wydrzynski, T. Biochemistry 2003, 42, 6209.
[34] (a) Ugur, I.; Rutherford, A. W.; Kaila, V. R. I. Biochim. Biophys. Acta, Bioenerg. 2016, 1857, 740;
(b) Shojia, M.; Isobec, H.; Yamaguchi, K. Chem. Phys. Lett. 2015, 636, 172.
[35] Sim, P. G.; Sinn, E. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 241.
[36] Harvey, J. N. WIREs Comput. Mol. Sci. 2014, 4, 1.
[37] Capone, M.; Bovi, D.; Narzi, D.; Guidoni, L. Biochemistry 2015, 54, 6439.
[38] Krewald, V.; Retegan, M.; Neese, F.; Lubitz, W.; Pantazis, D. A.; Cox, N. Inorg. Chem. 2016, 55, 488. |