化学学报 ›› 2003, Vol. 61 ›› Issue (7): 1121-1128. 上一篇    下一篇

研究论文

q~2引导构象选择CoMFA方法研究HIV-1RT抑制剂

曾宝珊;陈敏伯;董喜成;刘新泳   

  1. 中国科学院上海有机化学研究所.上海(200032);山东大学药学院药物化学研 究所,济南(250012)
  • 发布日期:2003-07-15

q~2 Guided Conformation Selection Approach of CoMFA for HIV-1 RT Inhibitors

Zeng Baoshan;Chen Minbo;Dong Xicheng;Liu Xinyong   

  1. Laboratory of Computer Chemistry, Shanghai Institute of Organic Chemistry, Chinese Academy of Sciences.Shanghai(200032);School of Pharmacology, Shandong University,Jinan(250012)
  • Published:2003-07-15

对未知受体结构的药物设计其主导方法CoMFA来说,柔性目标分子的多种构象 造成了问题的复杂性。本文介绍交叉验证参数R~2(q~2)引导的构象选择CoMFA方法 ,选择化合物的最佳构象。将一组47个HIV-1 RT抑制剂进行有、无构象选择的 CoMFA分析来作评价。根据化合物的活性、毒性、选择性指数(毒性/活性比)等 实验数据得到的模型,其交叉验证参数q~2为0.7以上,非交叉验证的相应参数为0. 94以上,最后,还经过试验集化合物验证该模型的预测能力,置信度(1-α)> 0.99。

关键词: 定量构效关系, 比较分子场分析, 构象

Key words: QUANTITATIVE STRUCTURE ACTIVITY RELATIONSHIP, CoMFA, CONFORMATION

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