化学学报 ›› 2003, Vol. 61 ›› Issue (7): 1129-1135. 上一篇    下一篇

研究论文

几种改进的CoMFA方法比较研究血小板活化因子拮抗剂

聂晶;董喜成;潘家祜   

  1. 复旦大学药学院.上海(200032);中国科学院上海有机化学研究所.上海 (200032)
  • 发布日期:2003-07-15

Comparison of Modified CoMFAs in Study of PAF Antagonist

Nie Jing;Dong Xicheng;Pan Jiahu   

  1. School of Pharmacy, Fudan University.Shanghai(200032);Key Laboratory of Computer Chemistry, Shanghai Institute of Organic Chemistry, Chinese Academy of Sciences.Shanghai(200032)
  • Published:2003-07-15

由于传统的比较分子场分析(CoMFA)方法本身存在一些缺陷,使得分子的叠合 规则以及叠合分子的空间取向和空间位置等因素对q~2的影响很大,因此相继提出 了几种改进的CoMFA方法。为了优化CoMFA结果,应用传统的CoMFA方法和交叉验证 的R~2引导的区域选择法(q~2-GRS)、全取向搜索法(AOS)、全空间搜索法(APS) 以及比较分子相似性指数(CoMSIA)等四种改进的CoMFA方法,对18个pinusolide类 衍生物这类新发现的血小板活化因子(PAF)拮抗剂进行了比较研究。结果表明四 种改进的CoMFA方法得到的q~2值均比传统CoMFA的高。q~2-GRS方法得到的q~2值有 所提高,但综合结果并不理想,AOS与APS得到的q~2较为理想,而在CoMSIA中, q~2几乎不受空间取向或空间位置的影响。同时我们引人基于样本的偏最小二乘法 (SAMPLS)取代原AOS/APS程序中的传统PLS进行统计分析,明显提高了其运行速 度。最后,根据q~2最高的CoMFA模型和CoMSIA模型设计了几个预测活性更高的 pinusolide类似物。

关键词: 比较分子场分析, 血小板活化因子拮抗剂, 比较分子相似性指数分析

Key words: CoMFA, PAF, CoMSIA

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