化学学报 ›› 2003, Vol. 61 ›› Issue (2): 273-278. 上一篇 下一篇
研究论文
陈晓燕;鲍伦军;莫金垣;蔡沛祥
Chen Xiaoyan;Bao Lunjun;Mo Jinyuan;Cai Peixiang
结合小波分析和分形理论,采用分数布朗运动(FBM)建立数学模型,研究脱氧 核糖核酸(DNA)序列的自相似性。用DNA walk的方式将DNA序列表达成为一个数字信 号,通过不同小波变换的尺度对应不同特征长度的碱基,选择墨西哥帽小波为母小 波,进行实验考察,结果发现小波系数的图形在许多尺度看上去很相似,大尺度对 应较多的碱基(小波变换尺度为2^7时,对应512个碱基),能看到概貌;小尺度对应 较少的碱基(小波变换尺度为2^3时,对应32个碱基),可看到细节。这表明其DNA序 列中存在分形结构,可以用分维数来作为定量描述。这种算法为进一步研究与基因 序列自相似结构有关的基因进化信息提供一种选择的途径。
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