周怡青 , 肖友利 . 活性天然产物靶标蛋白的鉴定[J]. 化学学报, 2018 , 76(3) : 177 -189 . DOI: 10.6023/A17110484

[1] Koehn, F. E.; Carter, G. T. Nat. Rev. Drug Discov. 2005, 4, 206.
[2] Calson, E. E. ACS Chem. Biol. 2010, 5, 639.
[3] Gao, Y.; Hu, J.; Ju, Y. Acta Chim. Sinica 2016, 74, 312(in Chinese). (高玉霞, 胡君, 巨勇, 化学学报, 2016, 74, 312.)
[4] Rodrigues, T.; Reker, D.; Schneider, P.; Schneider, G. Nat. Chem. 2016, 8, 531.
[5] Xu, Y.; Cheng, J. Chinese Sci. Bull. 2017, 62, 908(in Chinese). (徐悦, 程杰飞, 科学通报, 2017, 62, 908.)
[6] Schenone, M.; Dancik, V.; Wagner, B. K.; Clemons, P. A. Nat. Chem. Biol. 2013, 9, 232.
[7] Titov, D. V.; Liu, J. O. Bioorgan. Med. Chem. 2012, 20, 1902.
[8] Rix, U.; Superti-Furga, G. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 616.
[9] Geoghegan, K. F.; Johnson, D. S. Annu. Rep. Med. Chem. 2010, 45, 345.
[10] Kawatani, M.; Osada, H. MedChemComm 2014, 5, 277.
[11] Wang, C.; Chen, N. Acta Chim. Sinica 2015, 73, 657(in Chinese). (王初, 陈南, 化学学报, 2015, 73, 657.)
[12] Harding, M. W.; Galat, A.; Uehling, D. E.; Schreiber, S. L. Nature 1989, 341, 758.
[13] Taunton, J.; Hassig, C. A.; Schreiber, S. L. Science 1996, 272, 408.
[14] Sin, N.; Meng, L.; Wang, M. Q.; Wen, J. J.; Bornmann, W. G.; Crews, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1997, 94, 6099.
[15] Griffith, E. C.; Su, Z.; Turk, B. E.; Chen, S.; Chang, Y. H.; Wu, Z.; Biemann, K.; Liu, J. O. Chem. Biol. 1997, 4, 461.
[16] Griffith, E. C.; Su, Z.; Niwayama, S.; Ramsay, C. A.; Chang, Y.; Liu, J. O. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998, 95, 15183.
[17] Kudo, N.; Matsumori, N.; Taoka, H.; Fujiwara, D.; Scheriner, E. P.; Wolff, B.; Yoshida, M.; Horinouchi, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999, 96, 9112.
[18] Low, W. K.; Dang, Y.; Schneider-Poetsch, T.; Shi, Z.; Choi, N. S.; Rzasa, R. M.; Shea, H. A.; Li, S.; Park, K.; Ma, G.; Romo, D.; Liu, J. O. Method. Enzymol. 2007, 431, 303.
[19] Yamaoka, M.; Sato, K.; Kobayashi, M.; Nishio, N.; Ohkubo, M.; Fujii, T.; Nakajima, H. J. Antibiot. 2005, 58, 654.
[20] Bargagna-Mohan, P.; Hamza, A.; Kim, Y. E.; Ho, Y. K. A.; Mor-Vaknin, N.; Wendschlag, N.; Liu, J.; Evans, R. M.; Mar-kovitz, D. M.; Zhan, C.; Kim, K. B.; Mohan, R. Chem. Biol. 2007, 14, 623.
[21] Ki, S. W.; Ishigami, K.; Kitahara, T.; Kasahara, K.; Yoshida, M.; Horinouchi, S. J. Biol. Chem. 2000, 275, 39231.
[22] Dong, T.; Li, C.; Wang, X.; Dian, L.; Zhang, X.; Li, L.; Chen, S.; Cao, R.; Li, L.; Huang, N.; He, S.; Lei, X. Nat. Commun. 2015, 6, 6522.
[23] Margarucci, L.; Monti, M. C.; Cassiano, C.; Mozzicafreddo, M.; Angeletti, M.; Riccio, R.; Tosco, A.; Casapullo, A. Chem. Commun. 2013, 49, 5844.
[24] Cassiano, C.; Margarucci, L.; Exposito, R.; Riccio, R.; Tosco, A.; Casapullo, A.; Monti, M. C. Chem. Commun. 2014, 50, 6043.
[25] Klai?, L.; Morimoto, R. I.; Silverman, R. B. ACS Chem. Biol. 2012, 7, 928.
[26] Li, J.; Casteels, T.; Frogne, T.; Ingvorsen, C.; Honore, C.; Courtney, M.; Huber, K. V. M.; Schminer, N.; Kimmel, R. A.; Ramanov, R. A.; Sturtzel, C.; Lardeau, C.; Klughammer, J.; Farlik, M.; Sdelci, S.; Vieira, A.; Avolio, F.; Briand, F.; Baburin, I.; Majek, P.; Pauler, F. M.; Penz, T.; Stukalov, A.; Gridling, M.; Parapatics, K.; Barbieux, C.; Berishvili, E.; Spittler, A.; Colinge, J.; Bennett, K.; Hering, S.; Sulpice, T.; Bock, C.; Distel, M.; Harkany, T.; Meyer, D.; Superti-Furga, G.; Collombat, R.; Hechsher-Sorensen, J.; Kubicek, S. Cell 2017, 168, 86.
[27] Kong, L. M.; Deng, X.; Zuo, Z. L.; Sun, H. D.; Zhao, Q. S.; Li, Y. Oncotarget 2014, 5, 11354.
[28] Liu, C.; Yin, Q.; Zhou, H.; Wu, Y.; Pu, J.; Xia, L.; Liu, W.; Huang, X.; Jiang, T.; Wu, M.; He, L.; Zhao, Y.; Wang, X.; Xiao, W.; Chen, H.; Zhao, Q.; Zhou, A.; Wang, L.; Sun, H.; Chen, G. Nat. Chem. Biol. 2012, 8, 486.
[29] Zhao, Q.; Ding, Y.; Deng, Z.; Lee, O. Y.; Gao, P.; Chen, P.; Rose, R. J.; Zhao, H.; Zhang, Z.; Tao, X.; Heck, A. J. R.; Kao, R.; Yang, D. Chem. Sci. 2015, 6, 4124.
[30] Li, D.; Li, C.; Li, L.; Chen, S.; Wang, L.; Li, Q.; Wang, X.; Lei, X.; Shen, Z. Cell Chem. Biol. 2016, 23, 257.
[31] Yi, C. M.; Yu, J.; Kim, H.; Lee, N. R.; Kim, S. W.; Lee, N. J.; Lee, J.; Seong, J.; Kim, N. J.; Inn, K. S. Chem. Commun. 2017, 53, 7045.
[32] Capolupo, A.; Esposito, R.; Zampella, A.; Festa, C.; Roccio, R.; Casapullo, A.; Tosco, A., Monti, M. C. J. Nat. Prod. 2017, 80, 909.
[33] Kanoh, N.; Kumashiro, S.; Simizu, S.; Kondoh, Y.; Hatakeyama, S.; Tashiro, H.; Osada, H. Angew. Chem. Int. Ed. 2003, 115, 5742.
[34] Kanoh, N.; Honda, K.; Simizu, S.; Muroi, M.; Osada, H. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 3559.
[35] Hirohama, M.; Kumar, A.; Fukuda, I.; Matsuoka, S.; Igarashi, Y.; Saitoh, H.; Takagi, M.; Shinya, K.; Honda, K.; Kondoh, Y.; Saito, T.; Nakao, Y.; Osada, H.; Zhang, K. Y. J.; Yoshida, M.; Ito, A. ACS Chem. Biol. 2013, 8, 2635.
[36] Kolb, H. C.; Finn, M. G.; Sharpless, K. B. Angew. Chem. Int. Ed. 2001, 40, 2004.
[37] Kalesh, K. A.; Clulow, J. A.; Tate, E. W. Chem. Commun. 2015, 51, 5497.
[38] Ciepla, P.; Konitsiotis, A. D.; Serwa, R. A.; Masumoto, N.; Leong, W. P.; Dallman, M. J.; Magee, A. I.; Tate, E. W. Chem. Sci. 2014, 5, 4249.
[39] Kreuzer, J.; Bach, N. C.; Forler, D.; Sieber, S. A. Chem. Sci. 2015, 6, 237.
[40] Batternberg, O. A.; Yang, Y.; Verhelst, S. H. L.; Sieber, S. A. Mol. BioSyst. 2013, 9, 343.
[41] Wang, J.; Zhang, J.; Zhang, C.; Wong, Y. K.; Lim, T. K.; Hua, Z.; Liu, B.; Tannenbaum, S. R.; Shen, H.-M.; Lin, Q. Sci. Rep. 2016, 6, 22146.
[42] Wang, J.; Tan, X. F.; Nguyen, V. S.; Yang, P.; Zhou, J.; Gao, M.; Li, Z.; Lim, T. K.; He, Y.; Ong, C. S.; Lay, Y.; Zhang, J.; Zhu, G.; Lai, S.-L.; Ghosh, D.; Mok, Y. K.; Shen, H.-M.; Lin, Q. Mol. Cell. Proteomics 2014, 13, M113. 029793.
[43] Wang, J.; Zhang, C.; Chia, W.; Loh, C.; Li, Z.; Lee, Y.; He, Y.; Yuan, L.; Lim, T.; Liu, M.; Liew, C.; Lee, Y.; Zhang, J.; Lu, N.; Lim, C.; Hua, Z.; Liu, B.; Shen, H.-M.; Tan, S.; Lin, Q. Nat. Commun. 2015, 6, 10111.
[44] Ismail, H. M.; Barton, V.; Phanchana, M.; Charoensutthivarakul, S.; Wong, M. H. L.; Hemingway, J.; Biagini, G. A.; O'Neill, P. M.; Ward, S. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2016, 113, 2080.
[45] Zhou, Y.; Li, W.; Xiao, Y. ACS Chem. Biol. 2016, 11, 882.
[46] Zhou, Y.; Li, W.; Zhang, X.; Zhang, H.; Xiao, Y. Chem. Commun. 2016, 52, 14035.
[47] Li, J.; Cisar, J. S.; Zhou, C.-Y.; Vera, B.; Williams, H.; Rodrigurz, A. D.; Cravatt, B. F.; Romo, D. Nat. Chem. 2013, 5, 510.
[48] Nishino, M.; Choy, J. W.; Gushwa, N. N.; Oses-Prieto, J. A.; Koupparis, K.; Burlingame, A. L.; Renslo, A. R.; McKerrow, J. H.; Taunton, J. eLife 2013, 2, e00712.
[49] Zheng, B.; Zhu, S.; Wu, X. ACS Chem. Biol. 2015, 10, 115.
[50] Yang, J.; Tallman, K. A.; Porter, N. A.; Liebler, D. C. Anal. Chem. 2015, 87, 2535.
[51] Wright, M. H.; Tao, Y.; Drechsel, J.; Krysiak, J.; Chamni, S.; Weigert-Munoz, A.; Harvey, N. L.; Romo, D.; Sieber, S. A. Chem. Commun. 2017, DOI:10. 1039/C7CC04990K.
[52] Yang, M.; Chen, P. Acta Chim. Sinica 2015, 73, 783. (杨麦云, 陈鹏, 化学学报, 2015, 73, 783.)
[53] Smith, E.; Collins, I. Future Med. Chem. 2015, 7, 159.
[54] Park, J.; Koh, M.; Koo, J. Y.; Lee, S.; Park, S. B. ACS Chem. Biol. 2015, 11, 44.
[55] Kleiner, P.; Heydenreuter, W.; Stahl, M.; Korotkov, V. S.; Sieber, S. A. Angew. Chem. Int. Ed. 2017, 56, 1396.
[56] Lamos, S. M.; Krusemark, C. J.; McGee, C. J.; Scalf, M.; Smith, L. M.; Belshaw, P. J. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 4329.
[57] Eirich, J.; Orth, R; Sieber, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 12144.
[58] Shi, H.; Cheng, X.; Sze, S. K.; Yao, S. Q. Chem. Commun. 2011, 47, 11306.
[59] Hulce, J. J.; Cognetta, A. B.; Niphakis, M.; Tull, S. E.; Cravatt, B. F. Nat. Methods 2012, 10, 259
[60] Zhuang, S.; Li, Q.; Cai, L.; Wang, C.; Lei, X. ACS. Cent. Sci. 2017, 3, 501.
[61] Konziase, B. Anal. Biochem. 2015, 482, 25.
[62] Guo, H.; Xu, J.; Hao, P.; Ding, K.; Li, Z. Chem. Commun. 2017, 53, 9620.
[63] Lehmann, J.; Richers, J.; Pothig, A.; Sieber, S. A. Chem. Commun. 2017, 53, 107.
[64] Wang, D.; Cao, Y.; Zheng, L.; Lv, D.; Chen, L.; Xing, X.; Zhu, Z.; Li, X.; Chai, Y. Chem. Commun. 2017, 53, 5020.
[65] Zhou, Y.; Di, Z.; Li, X.; Shan, Y.; Li, W.; Zhang, H.; Xiao, Y. Chem. Commun. 2017, 53, 8671.
[66] Wright, M. H.; Fetzer, C.; Sieber, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 6152.
[67] Tamura, T.; Tsukiji, S.; Hamachi, I. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 2216.
[68] Hughes, C. C.; Yang, Y.; Liu, W.; Dorrestein, P. C.; La Clair, J. J.; Fenical, W. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 12094.
[69] Li, G.; Liu, Y.; Liu, Y.; Chen, L.; Wu, S.; Liu, Y.; Li, X. Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 9544.
[70] Park, J.; Oh, S.; Park, S. B. Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 5447.
[71] Leriche, G.; Chisholm, L.; Wagner, A. Bioorg. Med. Chem. 2012, 20, 571.
[72] Li, W.; Zhou, Y.; Tang, G.; Xiao, Y. Bioconjugate Chem. 2016, 27, 2828.
[73] Barglow, K. T.; Cravatt, B. F. Nat. Methods 2007, 4, 822.
[74] Abegg, D.; Frei, R.; Cerato, L.; Prasad Hari, D.; Wang, C.; Waser, J.; Adibekian, A. Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 10852.
[75] Wang, C.; Weerapana, E.; Blewett, M. M.; Cravatt, B. F. Nat. Methods 2014, 11, 79.
[76] Zhou, Y.; Li, W.; Wang, M.; Zhang, X.; Zhang, H.; Tong, X.; Xiao, Y. Mol. BioSyst. 2017, 13, 83.
[77] Grossman, E. A.; Ward, C. C.; Spradlin, J. N.; Bateman, L. A.; Huffman, T. R.; Miyamoto, D. K.; Kleinman, J. I.; Nomura, D. K. Cell Chem. Biol. 2017, 24, 1368.
[78] Tian, C.; Sun, R.; Liu, K.; Fu, L.; Liu, X.; Zhou, W.; Yang, Y.; Yang, J. Cell Chem. Biol. 2017, 24, 1416.
[79] Ong, S. E.; Blagoev, B.; Kratchmarova, I.; Kristensen, D. B.; Steen, H.; Pandey, A.; Mann, M. Mol. Cell. Proteomics 2002, 1, 376.
[80] Wiese, S.; Reidegeld, K. A.; Meyer, H. E.; Warscheid, B. Proteomics 2007, 7, 340.
[81] Thompson, A.; Schäfer, J.; Kuhn, K.; Kienle, S.; Schwarz, J.; Schmidt, G.; Neumann, T.; Hamon, C. Anal. Chem. 2003, 75, 1895.
[82] Wang, J.; Gao, L.; Lee, Y. M.; Kalesh, K. A.; Ong, Y. S.; Lim, J.; Jee, J.-E.; Sun, H.; Lee, S. S.; Hua, Z.-C.; Lin, Q. Pharmacol. Therapeut. 2016, 162, 10.
[83] Smith, G. P.; Petrenko, V. A. Chem. Rev. 1997, 97, 391.
[84] Jin, Y.; Yu, J.; Yu, Y. G. Chem. Biol. 2002, 9, 157.
[85] Takakusagi, Y.; Takakusagi, K.; Kuramochi, K.; Kobayashi, S.; Sugawara, F.; Sakaguchi, K. Bioorg. Med. Chem. 2007, 15, 7590.
[86] Zhu, H.; Snyder, M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 7, 55.
[87] Lomenick, B.; Hao, R.; Jonai, N.; Chin, R. M.; Aghajan, M.; Warburton, S.; Wang, J.; Wu, R. P.; Gomez, F.; Loo, J. A.; Wohlschlegel, J. A.; Vondriska, T. M.; Pelletier, J.; Herschman, H. R.; Clardy, J.; Clarke, C. F.; Huang, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009, 106, 21984.
[88] Chin, R. M.; Fu, X.; Pai, M. Y.; Vergnes, L.; Hwang, H.; Deng, G.; Diep, S.; Lomenick, B.; Meli, V. S.; Monsalve, G. C; Hu, E.; Whelan, S. A.; Wang, J. X.; Jung, G.; Solis, G. M.; Fazlollahi, F.; Kaweeteerawat, C.; Quach, A.; Nili, M.; Krall, A. S.; Godwin, H. A.; Chang, H. R.; Faull, K. F.; Guo, F.; Jiang, M.; Trauger, S. A.; Saghatelian, A.; Brass, D.; Christofk, H. R.; Clarke, C. F.; Teitell, M. A.; Petrascheck, M.; Reue, K.; Jung, M. E.; Frand, A. R.; Huang, J. Nature 2014, 510, 397.
[89] Fleta-Soriano, E.; Martinez, J. P.; Hinkelmann, B.; Gerth, K.; Washausen, P.; Diez, J.; Frank, R.; Sasse, F.; Meyerhans, A. Microb. Cell Fact. 2014, 13, 17.
[90] Hu, Y.-S. Ph. D. Dissertation, Second Military Medical University, Shanghai, 2013(in Chinese). (胡永胜, 博士论文, 第二军医大学, 上海, 2013.)
[91] Dal Piaz, F.; Vera Saltos, M. B.; Franceschelli, S.; Forte, G.; Marzocco, S.; Tuccinardi, T.; Poli, G.; Nejad Ebrahimi, S.; Hamburger, M.; De Tommasi, N.; Braca, A. J. Nat. Prod. 2016, 79, 2681.
[92] Molina, D. M.; Jafari, R.; Ignatushchenko, M.; Seki, T.; Larsson, E. A.; Dan, C.; Sreekumar, L.; Cao, Y.; Nordlund, P. Science 2013, 341, 84.
[93] Martinez, M. D.; Nordlund, P. Annu. Rev. Phamacol. 2016, 56, 141.
[94] Savitski, M. M.; Reinhard, F. B.; Franken, H.; Werner, T.; Savitski, M. F.; Eberhard, D.; Molina, D. M.; Jafari, R.; Dovega, R. B.; Klaeger, S.; Kuster, B. Science 2014, 346, 1255784.
[95] Reinhard, F. B.; Eberhard, D.; Werner, T.; Franken, H.; Childs, D.; Doce, C.; Savitski, M. F.; Huber, W.; Bantscheff, M.; Savitski, M. M.; Drewes, G. Nat. Methods 2015, 12, 1129.
[96] Huber, K. V.; Olek, K. M.; Müller, A. C.; Tan, C. S. H.; Bennett, K. L.; Colinge, J.; Superti-Furga, G. Nat. Methods 2015, 12, 1055.
[97] Becher, I.; Werner, T.; Doce, C.; Zaal, E. A.; Tögel, I.; Khan, C. A.; Rueger, A.; Muelbaier, M.; Salzer, E.; Berkers, C. R.; Fitzpatrick, P. F.; Bantscheff, M.; Savitski, M. M. Nat. Chem. Biol. 2016, 12, 908.
[98] Franken, H.; Mathieson, T.; Childs, D.; Sweetman, G. M.; Werner, T.; Tögel, I.; Doce, C.; Gade, S.; Bantscheff, M.; Drewes, G.; Reinhard, F. B. Nat. Protoc. 2015, 10, 1567.
[99] Park, H.; Ha, J.; Koo, J. Y.; Park, J.; Park, S. B. Chem. Sci. 2017, 8, 1127.
[100] West, G. M.; Tucker, C. L.; Xu, T.; Park, S. K.; Han, X.; Yates, J. R.; Fitzgerald M. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010, 107, 9078.
[101] Chan, J. N.; Vuckovic, D.; Sleno, L.; Olsen, J. B.; Pogoutse, O.; Havugimana, P. C.; Hewel, J. A.; Bajaj, N.; Wang, Y.; Musteata, M. F.; Nislw, C.; Emili, A. Mol. Cell. Proteomics 2012, 11, M111. 016642.
[102] Parsons, A. B.; Lopez, A.; Givoni, I. E.; Williams, D. E.; Gray, C. A.; Porter, J.; Chua, G.; Sopko, R.; Brost, R. L.; Ho, C. H.; Wang, J.; Ketela, T.; Brenner, C.; Brill, J. A.; Femandez, G. E.; Lorenz, T. C.; Payne, G. S.; Ishihara, S.; Ohya, Y.; Andrews, B.; Hughes, T. R.; Frey, B. J.; Graham, T. R.; Andersen, R. J.; Boone, C. Cell 2006, 126, 611.
[103] Ho, C. H.; Magtanong, L.; Barker, S. L.; Gresham, D.; Nishimura, S.; Natarajan, P.; Koh, J. L.; Porter, J.; Gray, C. A.; Andersen, R. J.; Giaever, G. Nat. Biotech. 2009, 27, 369.
[104] Luesch, H.; Wu, T. Y.; Ren, P.; Gray, N. S.; Schultz, P. G.; Supek, F. Chem. Biol. 2005, 12, 55.
[105] Smith, A. M.; Ammar, R.; Nislow, C.; Giaever, G. Pharmacol. Therapeut. 2010, 127, 156.
[106] Lum, P. Y.; Armour, C. D.; Stepaniants, S. B.; Cavet, G.; Wolf, M. K.; Butler, J. S.; Hinshaw, J. C.; Garnier, P.; Prestwich, G. D.; Leonardson, A.; Garrett-Engele, P.; Leonardson, A. Cell 2004, 116, 121.
[107] Sopko, R.; Huang, D.; Preston, N.; Chua, G.; Papp, B.; Kafadar, K.; Snyder, M.; Oliver, S. G.; Cyert, M.; Hughes, T. R.; Boone, C.; Andrews, B. Mol. Cell 2006, 21, 319.
[108] Chen, X.; Ung, C. Y.; Chen, Y. Nat. Prod. Rep. 2003, 20, 432.
[109] Chen, X.; Ji, Z. L.; Chen, Y. Z. Nucleic Acids Res. 2002, 30, 412.
[110] Gao, Z.; Li, H.; Zhang, H.; Liu, X.; Kang, L.; Luo, X.; Zhu, W.; Chen, K.; Wang, X.; Jiang, H. BMC Bioinformatics 2008, 9, 104.
[111] Chen, L.; Oughtred, R.; Berman, H. M.; Westbrook, J. Bioinformatics 2004, 20, 2860.
[112] Ji, Z. L.; Han, L. Y.; Yap, C. W.; Sun, L. Z.; Chen, X.; Chen, Y. Z. Drug Safety 2003, 26, 685.
[113] Wishart, D. S.; Knox, C.; Guo, A. C.; Cheng, D.; Shrivastava, S.; Tzur, D.; Gautam, B.; Hassanali, M. Nucleic Acids Res. 2007, 36, D901.
[114] Zhang, J. X.; Huang, W. J.; Zeng, J. H.; Huang, W. H.; Wang, Y.; Zhao, R.; Han, B. C.; Liu, Q. F.; Chen, Y. Z.; Ji, Z. L. Bioinformatics 2007, 23, 1710.
[115] Chen, Y. Z.; Ung, C. Y. Am. J. Chin. Med. 2002, 30, 139.
[116] Li, H.; Gao, Z.; Kang, L.; Zhang, H.; Yang, K.; Yu, K.; Luo, X.; Zhu, W.; Chen, K.; Shen, J.; Wang, X.; Jiang, H. Nucleic Acids Res. 2006, 34, W219.
[117] Liu, X.; Ouyang, S.; Yu, B.; Liu, Y.; Huang, K.; Gong, J.; Zheng, S.; Li, Z.; Li, H.; Jiang, H. Nucleic Acids Res. 2010, 38, W609.
[118] Kinnings, S. L.; Jackson, R. M. J. Chem. Inf. Model. 2011, 28, 624.
[119] Wang, J. C.; Chu, P. Y.; Chen, C. M.; Lin, J. H. Nucleic Acids Res. 2012, 40, W393.
[120] Friesner, R. A.; Banks, J. L.; Murphy, R. B.; Halgren, T. A.; Klicic, J. J.; Mainz, D. T.; Repasky, M. P.; Knoll, E. H.; Shelley, M.; Perry, J. K.; Shaw, D. E. J. Med. Chem. 2004, 47, 1739.
[121] Park, K.; Cho, A. E. J. Ginseng. Res. 2017, 41, 534.
[122] Smith, A. M.; Ammar, R.; Nislow, C.; Giaever, G. Pharmacol. Therapeut. 2010, 127, 156.
[123] Rees, M. G.; Seashore-Ludlow, B.; Cheah, J. H.; Adams, D. J.; Price, E. V.; Gill, S.; Javaid, S.; Coletti, M. E.; Jones, V. L.; Bodycombe, N. E.; Soule, C. K.; Alexander, B.; Li, A.; Montgomery, P.; Kotz, J. D.; Hon, C. S.; Munoz, B.; Liefeld, T.; Dancik, V.; Haber, D. A.; Clish, C. B.; Bittker, J. A.; Palmer, M.; Wagner, B. K.; Clemons, P. A.; Shamji, A. F.; Schreiber, S. L. Nat. Chem. Biol. 2016, 12, 109.
[124] Yue, Q.; Feng, L.; Cao, B.; Liu, M.; Zhang, D.; Wu, W.; Jiang, B.; Yang, M.; Liu, X.; Guo, D. Mol. Cell. Proteomics 2016, 15, 26.
[125] Prieto, J. H.; Koncarevic, S.; Park, S. K.; Yates, J.; Becker, K. PLoS One 2008, 3, e4098.
[126] Kong, Q.; Tong, Q.; Lou, D.; Ding, J.; Zheng, B.; Chen, R.; Zhu, X.; Chen, X.; Dong, K.; Lu, S. Mol. BioSyst. 2015, 11, 1400.
[127] Hansen, J.; Palmfeldt, J.; Vang, S.; Corydon, T. J.; Gregersen, N.; Bross, P. PLoS One 2011, 6, e26634.
[128] Xu, Y.; Wang, Y.; Yan, L.; Liang, R. M.; Dai, B. D.; Tang, R. J.; Gao, P. H., Jiang, Y. Y. J. Proteome Res. 2009, 8, 5296.
[129] D'Aguanno, S.; D'Agnano, I.; De Canio, M.; Rossi, C.; Bernardini, S.; Federici, G.; Urbani, A. Mol. BioSyst. 2012, 8, 1068.
[130] Towbin, H.; Bair, K. W.; DeCaprio, J. A.; Eck, M. J.; Kim, S.; Kinder, F. R.; Morollo, A.; Mueller, D. R.; Schindler, P.; Song, H. K.; Van Oostrum, J. J. Biol. Chem. 2003, 278, 52964.
[131] Futamura, Y.; Kawatani, M.; Kazami, S.; Tanaka, K.; Muroi, M.; Shimizu, T.; Tomita, K.; Watanabe, N.; Osada, H. Chem. Biol. 2012, 19, 1620.
[132] Futamura, Y.; Yamamoto, K; Osada, H. Biosci. Biotechnol. Biochem. 2017, 81, 28.
[133] Shoemaker, R. H. Nat. Rev. Cancer 2006, 6, 813.
[134] Bai, R.; Paull, K. D.; Herald, C. L.; Malspeis, L.; Pettit, G. R.; Hamel, E. J. Biol. Chem. 1991, 266, 15882.
[135] Kurita, K. L.; Glassey, E.; Linington, R. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2015, 112, 11999.
[136] Lu, Y.; Zhang, Y.; Li, L.; Feng, X.; Ding, S.; Zheng, W.; Li, J.; Shen, P. Chem. Biol. 2014, 21, 246.
[137] Leuenroth, S. J.; Okuhara, D.; Shotwell, J. D.; Markowitz, G. S.; Yu, Z.; Somlo, S.; Crews, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007, 104, 4389.
[138] Corson, T. W.; Cavga, H.; Aberle, N.; Crews, C. M. ChemBioChem 2001, 12, 1767.
[139] Vispé, S.; DeVries, L.; Créancier, L.; Besse, J.; Bréand, S.; Hobson, D. J.; Svejstrup, J. Q.; Annereau, J. P.; Cussac, D.; Dumontet, C.; Guilbaud, N. Mol. Cancer Therapeut. 2009, 8, 2780.
[140] Leuenroth, S. J.; Crews, C. M. Chem. Biol. 2005, 12, 1259.
[141] McCallum, C.; Kwon, S.; Leavitt, P.; Shen, D. M.; Liu, W.; Gurnett, A. Immunobiology 2007, 212, 549.
[142] Titov, D. V.; Gilman, B.; He, Q.-L.; Bhat, S.; Low, W. K.; Dang, Y.; Smeaton, M.; Demain, A. L.; Miller, P. S.; Kugel, J. F.; Goodrich, J. A.; Liu, J. O. Nat. Chem. Biol. 2011, 7, 182.
[143] He, Q. L.; Titov, D. V.; Li, J.; Tan, M.; Ye, Z.; Zhao, Y.; Romo, D.; Liu, J. O. Angew. Chem. Int. Ed. 2015, 54, 1859.
[144] McClary, B.; Zinshteyn, B.; Meyer, M.; Jouanneau, M.; Pellegrino, S.; Yusupova, G.; Schuller, A.; Reyes, J. C. P.; Lu, J.; Guo, Z.; Ayinde, S.; Luo, C.; Dang, Y.; Romo, D.; Yusupov, M.; Green, R.; Liu, J. O. Cell Chem. Biol. 2017, 24, 605.