1 Weber, I. T. J. Biol. Chem. 1990, 265, 10492.
2 Kollman, P. A.; Massova, I.; Reyes, C.; Kuhn, B.; Huo, S.;
Chong, L.; Lee, M.; Lee, T.; Duan, Y.; Wang, W.; Donini,
O.; Cieplak, P.; Srinivasan, J.; Case, D. A.; Cheatham, T. E.
Acc. Chem. Res. 2000, 33, 889.
3 Hu, G.-D.; Zhang, S.-L.; Zhang, Q.-G. Acta. Chim. Sinica
2009, 67, 1019 (in Chinese).
(扈国栋, 张少龙, 张庆刚, 化学学报, 2009, 67, 1019.)
4 Wu, E. L.; Han, K. L.; Zhang, J. Z. H. Chem. Eur. J. 2008,
14, 8704.
5 Wu, E. L.; Wong, K. Y.; Zhang, X.; Han, K. L.; Gao, J. L. J.
Phys. Chem. B 2009, 113, 2477.
6 Wang, W.; Donini, O.; Reyes, C.; Kollman, P. Annu. Rev.
Biophys. Biomol. Struct. 2001, 30, 211.
7 Stoica, I.; Sadiq, S. K.; Coveney, P. V. J. Am. Chem. Soc.
2008, 130, 2639.
8 Chen, X.; Tropsha, A. J. Med. Chem. 1995, 38, 42.
9 Wittayanarakul, K.; Aruksakunwong, O.; Saen-oon, S.;
Chantratita, W.; Parasuk, V.; Sompornpisut, P.; Hannongbua,
S. Biophys. J. 2005, 88, 867.
10 Hou, T.; Yu, R. J. Med. Chem. 2007, 50, 1177.
11 Mahalingam, B.; Wang, Y. F.; Boross, P. I.; Tozser, J.;
Louis, J. M.; Harrison, R. W.; Weber, I. T. Eur. J. Biochem.
2004, 271, 1516.
12 Duan, Y.; Wu, C.; Chowdhury, S.; Lee, M. C.; Xiong, G.;
Zhang, W.; Yang, R.; Cieplak, P.; Luo, R.; Lee, T.; Caldwell,
J.; Wang, J.; Kollman, P. J. Comput. Chem. 2003, 24,
1999.
13 Wang, J.; Wolf, R. M.; Caldwell, J. W.; Kollamn, P. A.;
Case, D. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157.
14 Cieplak, P.; Cornell, W. D.; Bayly, C.; Kollman, P. A. J.
Comput. Chem. 1995, 16, 1357.
15 David, A. C.; Thomas, E. C. III.; Tom, D.; Holger, G.; Ray,
L.; Kenneth, M. M. Jr.; Alexey, O.; Carlos, S.; Bing, W.;
Robert, J. W. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1668.
16 Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madurs, J. D.; Impey,
R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.
17 Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Chem.
Phys. 1977, 23, 327.
18 Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98,
10089.
19 Xu, Y.; Wang, R. X. Protein 2006, 64, 1058.
20 Hu, J.-P.; Sun, T.-G.; Chen, W.-Z.; Wang, C.-X. Acta Chim.
Sinica 2006, 64, 2079 (in Chinese).
(胡建平, 孙庭广, 陈慰祖, 王存新, 化学学报, 2006, 64,
2079.)
21 Jiang, Y.-J.; Zeng, M.; Zhou, X.-B.; Zou, J.-W.; Yu, Q.-S.
Acta Chim. Sinica 2004, 62, 1751 (in Chinese).
(蒋勇军, 曾敏, 周先波, 邹建卫, 俞庆森, 化学学报,
2004, 62, 1751.)
22 Lu, Y.; Yang, C.; Wang, S. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128,
11830.
23 Duan, L. L.; Tong, Y.; Mei, Y.; Zhang, Q. G.; Zhang, J. Z.
H. J. Chem. Phys. 2007, 127, 145101.
24 Chen, J. Z.; Yang, M. Y.; Hu, G. D.; Shi, S. H.; Yi, C. H.;
Zhang, Q. G. J. Mol. Model. DOI 10.1007/s00894-009-
0452-y.