新型N-[2-((取代苯基)氨基)吡啶-3-基]嘧啶甲酰胺的合成、杀菌活性及分子对接

doi:10.6023/cjoc202002019

有机化学 ›› 2020, Vol. 40 ›› Issue (7): 1948-1954.DOI: 10.6023/cjoc202002019 上一篇下一篇

研究论文

新型N-[2-((取代苯基)氨基)吡啶-3-基]嘧啶甲酰胺的合成、杀菌活性及分子对接

时艳华, 张帅, 万福贤, 孙昌兴, 姜林

山东农业大学化学与材料科学学院山东泰安 271018

收稿日期:2020-02-17 修回日期:2020-03-15 发布日期:2020-04-10
通讯作者: 姜林 E-mail:jiangl@sdau.edu.cn
基金资助:
山东省自然科学基金（No.ZR2014BM030）资助项目.

Synthesis, Fungicidal Activity and Molecular Docking Study of Novel N-[2-((Substitutedphenyl)amino)pyridin-3-yl]-pyrimidine-4-carboxamides

Shi Yanhua, Zhang Shuai, Wan Fuxian, Sun Changxing, Jiang Lin

College of Chemistry and Material Science, Shandong Agricultural University, Tai'an, Shandong 271018

Received:2020-02-17 Revised:2020-03-15 Published:2020-04-10
Supported by:
Project supported by the Natural Science Foundation of Shandong Province (No. ZR2014BM030).

文章分享

1. 201948S.pdf(3746KB)

摘要/Abstract

为寻找新型结构的琥珀酸脱氢酶抑制剂，以高效杀菌剂啶酰菌胺为先导化合物，设计、合成了17种N-[2-（（取代苯基）氨基）吡啶-3-基]-4-甲基-2-甲硫基嘧啶-5-甲酰胺（4a～4g）和N-[2-（（取代苯基）氨基）吡啶-3-基]-4-甲氧基-2-甲硫基嘧啶-5-甲酰胺（4h～4q），并通过¹H NMR、¹³C NMR和MALDI-TOF-MS确证了化合物的结构.离体杀菌活性试验表明，在剂量为50 μg/mL时，16种化合物对菌核菌表现出较高的杀菌活性，抑制率在90%以上.一些化合物在此剂量下对灰霉菌显示出中等活性，抑制率为70%～84%.分子对接研究揭示了具有较高活性的化合物，N-[2-（（3-氟-4-甲基苯基）氨基）吡啶-3-基]-2-甲硫基-4-甲氧基嘧啶-5-甲酰胺（4p）与琥珀酸脱氢酶（SDH）靶酶氨基酸形成4个氢键和一个阳离子-π相互作用.

关键词: 嘧啶, 酰胺, 合成, 杀菌活性, 分子对接

To explore succinate dehydrogenase inhibitor with new structure, the excellent fungicide boscalid was chosen as a lead compound, and seventeen N-[2-((substitutedphenyl)amino)pyridin-3-yl]-4-methyl-2-(methylthio)pyrimidine-5-carbox-amides (4a~4g) and N-[2-((substitutedphenyl)amino)pyridin-3-yl]-4-methoxy-2-(methylthio)pyrimidine-5-carboxamides (4h~4q) were designed and synthesized. The structures of target compounds were characterized by ¹H NMR, ¹³C NMR, and MALDI-TOF-MS. The in vitro bioassay showed that sixteen compounds possessed high fungicidal activity against S. sclerotiorum with more than 90% inhibitory rate at 50 μg/mL, and some compounds showed moderate activity against B. cinerea at the same dose with inhibitory rate in the range of 70%~84%. The molecular docking study revealed that four hydrogen bonds and one cation-π interaction were formed between N-[2-((3-fluoro-4-methylphenyl)amino)pyridin-3-yl]-4-methoxy-2-(methyl-thio)pyrimidine-5-carboxamide (4p) and succinate dehydrogenase (SDH) enzyme.

Key words: pyrimidine, carboxamide, synthesis, fungicidal activity, molecular docking

引用此文

时艳华, 张帅, 万福贤, 孙昌兴, 姜林. 新型N-[2-((取代苯基)氨基)吡啶-3-基]嘧啶甲酰胺的合成、杀菌活性及分子对接[J]. 有机化学, 2020, 40(7): 1948-1954.

Shi Yanhua, Zhang Shuai, Wan Fuxian, Sun Changxing, Jiang Lin. Synthesis, Fungicidal Activity and Molecular Docking Study of Novel N-[2-((Substitutedphenyl)amino)pyridin-3-yl]-pyrimidine-4-carboxamides[J]. Chinese Journal of Organic Chemistry, 2020, 40(7): 1948-1954.

导出引用 EndNote|Reference Manager|ProCite|BibTeX|RefWorks

分享此文

参考文献

[1] Du, S.-J.; Qin, Z.-H. Chin. J. Pestic. Sci. 2018, 20, 545(in Chinese). (杜士杰, 覃兆海, 农药学学报, 2018, 20, 545.)
[2] Zhu, X.-L.; Hu, S.-Q.; Jiang, L.-N.; Yang, W.-C.; Yang, G.-F. Sci. Sin. Chim. 2016, 46, 1188(in Chinese). (朱晓磊, 胡生全, 蒋莉娜, 杨文超, 杨光富, 中国科学:化学, 2016, 46, 1188.)
[3] (a) Yang, G.-F.; Xiong, L.; Chen, Q. CN 104557709, 2013[Chem. Abstr. 2013, 162, 590243]
(b) Xiong, L.; Zhu, X. -L.; Shen, Y.-Q.; Wishwajith, W. K. W. M.; Li, K.; Yang, G.-F. Eur. J. Med. Chem. 2015, 95, 424
[4] Wang, H.-Y.; Gao, X.-H.; Zhang, X.-X,; Jin, H.; Tao, K.; Hou, T.-P. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2017, 27, 90.
[5] Guo, X.-F.; Zhao, B.; Fan, Z.-J.; Yang, D.-Y.; Zhang, N.-L.; Wu, Q.-F.; Yu, B.; Zhou, S.; Kalinina, T. A.; Belskaya, N. P. J. Agric. Food Chem. 2019, 67, 1647.
[6] Liu, X.-H, Qiao, L.; Zhai, Z.-W.; Cai, P.-P.; Cantrell, C. L.; Tan, C.-X.; Weng, J.-Q.; Han, L.; Wu, H.-K. Pest Manag. Sci. 2019, 75, 2892.
[7] Sun, N.-B.; Shen, Z.-H.; Zhai, Z.-W.; Han, L.; Weng, J.-Q.; Tan, C.-X.; Liu, X.-H. Chin. J. Org. Chem. 2017, 37, 2705(in Chinese). (孙娜波, 沈钟华, 翟志文, 韩亮, 翁建全, 谭成侠, 刘幸海, 有机化学, 2017, 37, 2705.)
[8] Chen, M.-H.; Wu, W.-N.; Chen, L.-J.; Shu, H. Agrochemicals 2017, 56, 474(in Chinese).(陈美航, 吴文能, 陈丽娟, 舒华, 农药, 2017, 56, 474.)
[9] Meng, Y.-Q.; Li, E.-D.; Zhang, Y.; Zhao, P.-R.; Ke, Y.; Zhang, Q.-R.; Liu, H.-M. Chin. J. Org. Chem. 2019, 39, 2541(in Chinese). (孟娅琪, 李二冬, 张洋, 赵培荣, 可钰, 张秋荣, 刘宏民, 有机化学, 2019, 39, 2541.)
[10] Tǎnase, C. I.; Drǎghici, C.; Cojocaru, A.; Galochkina, A. V.; Orshanskaya, J. R.; Zarubaev, V. V.; Shova, S.; Enache, C.; Maganu, M. Bioorg. Med. Chem. 2015, 23, 6346.
[11] Li, L.; Zhang, W.-P.; Lin, F.; Lu, X.-Q.; Chen, W.; Li, X.-Z.; Zhou, X.-B.; Su, R.-B. Wang, L.-L.; Zheng, Z.-B.; Li, S. Eur. J. Med. Chem. 2019, 173, 107.
[12] Tang, X.-M.; Fan, L.; Zhang, Z.-C.; Yang, D.-C. Chin. J. Org. Chem. 2019, 39, 1460(in Chinese). (唐雪梅, 范莉, 张泽朝, 杨大成, 有机化学, 2019, 39, 1460.)
[13] (a) He, H.-F.; Xia, Q.; He, H.-W. Chin. J. Org. Chem. 2019, 39, 2295(in Chinese). (何海峰, 夏芹, 贺红武, 有机化学, 2019, 39, 2295.)
(b) Wang, J.-Y.; Tao, H.; Jin, M.; Li, L.-S.; Xiao, Y.-M.; Li, J.-Q.; Qin, Z.-H. Chin. J. Org. Chem. 2019, 39, 1044(in Chinese). (王家尧, 陶晗, 金蜜, 李丽莎, 肖玉梅, 李佳奇, 覃兆海, 有机化学, 2019, 39, 1044.)
[14] Dai, H.; Ye, L.-Y.; Li, Y.; Fang, Y.; Shi, Y.-J.; Liang, Z.- P.; Shi, J. Chin. J. Org. Chem. 2017, 37, 1020(in Chinese). (戴红, 叶林玉, 李阳, 方源, 石玉军, 梁志鹏, 石健, 有机化学, 2017, 37, 1020.)
[15] Wang, M.-R.; Sun, L.-Y.; Wan, F.-X.; Jiang, L. J. Pestic. Sci, 2012, 37, 15.
[16] Liu, F.-D. M.S. Thesis, Central China Normal University, Wuhan, 2016 (in Chinese). (刘福娣, 硕士论文, 华中师范大学, 武汉, 2016.)
[17] Huang, H.; Hutta, D. A.; Rinker, J. M.; Hu, H.; Parsons, W. H.; Schubert, C.; DesJarlais, R. L.; Yurkow, E.; Manthey, C. L.; Player, M. R. J. Med. Chem. 2009, 52, 1081.
[18] Du, S.-J.; Tian, Z.-M.; Yang, D.-Y.; Li, X.-Y.; Li, H.; Jia,C.-Q.; Che, C.-L.; Wang, M.; Qin, Z.-H. Molecules 2015, 20, 839
[19] Sun, N.-B.; Shen, Z.-H.; Zhai, Z.-W.; Wu, H.-K.; Weng, J.-Q.; Tan, C.-X.; Liu, X.-H. Chin. J. Org. Chem. 2017, 37, 2044(in Chinese). (孙娜波, 沈钟华, 翟志文, 武宏科, 翁建全, 谭成侠, 刘幸海, 有机化学, 2017, 37, 2044.)
[20] Yuriev, E.; Ramsland, P. A. J. Mol. Recognit. 2013, 26, 215.
[21] Abe, T.; Tamai, R.; Ito, M.; Tamaru, M.; Yano, H.; Takahashi, S.; Muramatsu, N. US 20040248872, 2004[Chem. Abstr. 2004, 138, 304304].
[22] (a) Wang, H.-T.; Wang, H.-Y.; Yang, L.-R.; Mao, P.; Qu, L.-B. Chin. J. Appl. Chem. 2015, 32, 412(in Chinese). (王海涛, 王宏雁, 杨亮茹, 毛璞, 屈凌波, 应用化学, 2015, 32, 412.)
(b) Wang, S.-C.; Wan, F.-X.; Liu, S.; Zhang, S.; Jiang, L. J. Chin. Chem. Soc. 2018, 65,445.
[23] Kamal, A.; Hussaini, S. M. A.; Nayak, V. L.; Malik, M. S.; Sucharitha, M. L.; Shaik, T. B.; Ashraf, M. Bagul, C. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2014, 22, 6755.
[24] (a) Liu, S.; Qian, P.; Wan, F.-X.; Shi, Y.-H.; Jiang, L. J. Chin. Chem. Soc. 2019, 66, 330.
(b) Sun, J.-L.; Mu, W. Pesticide Science Experimental Techniques and Guidance, Chemical Industry Press, Beijing, 2009, p. 228, p. 229(in Chinese). (孙家隆, 慕卫, 农药实验技术与指导, 化学工业出版社, 北京, 2009, p. 228, p. 229.)

新型N-[2-((取代苯基)氨基)吡啶-3-基]嘧啶甲酰胺的合成、杀菌活性及分子对接

Synthesis, Fungicidal Activity and Molecular Docking Study of Novel N-[2-((Substitutedphenyl)amino)pyridin-3-yl]-pyrimidine-4-carboxamides

PDF

补充材料

可视化

摘要/Abstract

引用此文

分享此文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

相关统计

本文评价

[1]	邹发凯, 王能中, 姚辉, 王慧, 刘明国, 黄年玉. 1β-/3R-芳基硫代糖的区域与立体选择性合成[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 593-604.
[2]	吴思敏, 唐嘉欣, 周于佳, 徐学涛, 张昊星, 王少华. 2β-Acetoxyferruginol去醋酸基骨架衍生物抑制α-葡萄糖苷酶活性研究[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 613-621.
[3]	李路瑶, 贺忠文, 张振国, 贾振华, 罗德平. 三芳基碳正离子在有机合成中的应用[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 421-437.
[4]	黄净, 杨毅华, 张占辉, 刘守信. 酰胺键的绿色高效构建方法与技术进展[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 409-420.
[5]	梅青刚, 李清寒. 可见光促进C(3)(杂)芳硫基吲哚化合物的合成研究进展[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 398-408.
[6]	冯康博, 陈炯, 古双喜, 王海峰, 陈芬儿. 全连续流反应技术在药物合成中的新进展(2019~2022)[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 378-397.
[7]	李洋, 董亚楠, 李跃辉. 经由N-硼基酰胺中间体的酰胺高效转化合成腈类化合物[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 638-643.
[8]	李鹏辉, 谢青洋, 万福贤, 张元红, 姜林. 含环丙基的新型取代嘧啶-5-甲酰胺的合成及杀菌活性研究[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 650-656.
[9]	高宝昌, 石雨, 田媛, 张治国, 张婧如, 孙宇峰, 毛国梁, 戴凌燕. 4-甲基-2-氧代-6-芳氨基-二氢-吡喃-3-腈衍生物的合成[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 644-649.
[10]	陶苏艳, 项紫欣, 白俊杰, 万潇, 万小兵. 亚硝酸叔丁酯参与的酰胺水解反应[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 550-560.
[11]	江港钟, 林嘉欣, 鲍晓光, 万小兵. 亚硝酸异戊酯活化伯磺酰胺制备磺酰溴与磺酰氯[J]. 有机化学, 2024, 44(2): 533-549.
[12]	杨维清, 葛宴兵, 陈元元, 刘萍, 付海燕, 马梦林. 1,8-萘酰亚胺衍生物的设计、合成及其对半胱氨酸的识别研究[J]. 有机化学, 2024, 44(1): 180-194.
[13]	黄志友, 杨平, 何波, 欧文霞, 袁思雨. 吗啉磺酰胺化合物的设计、合成及其抑制大豆萌芽活性的研究[J]. 有机化学, 2024, 44(1): 309-315.
[14]	于士航, 刘嘉威, 安碧玉, 边庆花, 王敏, 钟江春. 黑腹尼虎天牛接触性信息素的不对称合成[J]. 有机化学, 2024, 44(1): 301-308.
[15]	赵茜帆, 陈永正, 张世明. 碳基非金属催化剂在有机合成领域的应用及机理研究[J]. 有机化学, 2024, 44(1): 137-147.